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Configuration

Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)

Evo 2 7B: 7B parameters; context extended to 1,048,576 tokens.

45 evaluations · 90 results

Overview

An explanatory profile has not yet been reviewed for this record.

Consult the linked sources for architecture or protocol details. Missing evidence is not evidence of a missing capability.

Evaluations and results

45 evaluations · 90 results. Different protocols are not a single leaderboard.

Sorted by AUPRC (zero-shot; BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs) (higher is better). The best value in each column is highlighted. Decimals are rounded for display; each value links to the printed value and its source.

Tested configurationProtocol and datasetAUPRC (zero-shot; BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUPRC (zero-shot; BRCA1 coding SNVs)AUPRC (zero-shot; BRCA1 intronic SNVs)AUPRC (zero-shot; BRCA1 noncoding SNVs)AUPRC (zero-shot; BRCA1 splice region SNVs)AUPRC (zero-shot; BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUPRC (zero-shot; BRCA2 coding SNVs)AUPRC (zero-shot; BRCA2 noncoding SNVs)AUPRC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels)AUPRC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants)AUPRC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding indels)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding microsatellite variants)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, far from splice site)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, highly conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, moderately conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, not conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, poorly conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, far from splice site)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, highly conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, moderately conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, near splice site)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, not conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, poorly conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar coding SNVs)AUPRC (zero-shot; ClinVar low SpliceAI and Pangolin scores (both below 0.1) non-SNVs)AUPRC (zero-shot; ClinVar low SpliceAI and Pangolin scores (both below 0.1) SNVs)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding indels)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding microsatellite variants)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, far from splice site)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, highly conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, intergenic)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, moderately conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, near splice site)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, not conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, poorly conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, far from splice site)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, highly conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, intergenic)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, moderately conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, near splice site)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, not conserved)AUPRC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, poorly conserved)AUPRC (zero-shot; SpliceVarDB 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUPRC (zero-shot; SpliceVarDB exonic SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA1 coding SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA1 intronic SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA1 noncoding SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA1 splice region SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA2 coding SNVs)AUROC (zero-shot; BRCA2 noncoding SNVs)AUROC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels)AUROC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants)AUROC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUROC (zero-shot; ClinVar coding indels)AUROC (zero-shot; ClinVar coding microsatellite variants)AUROC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, far from splice site)AUROC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, highly conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, moderately conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, not conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding non-SNVs, poorly conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, far from splice site)AUROC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, highly conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, moderately conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, near splice site)AUROC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, not conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding SNVs, poorly conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar coding SNVs)AUROC (zero-shot; ClinVar low SpliceAI and Pangolin scores (both below 0.1) non-SNVs)AUROC (zero-shot; ClinVar low SpliceAI and Pangolin scores (both below 0.1) SNVs)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding indels)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding microsatellite variants)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, far from splice site)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, highly conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, intergenic)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, moderately conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, near splice site)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, not conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding non-SNVs, poorly conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, far from splice site)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, highly conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, intergenic)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, moderately conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, near splice site)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, not conserved)AUROC (zero-shot; ClinVar noncoding SNVs, poorly conserved)AUROC (zero-shot; SpliceVarDB 'Both' (coding and noncoding) SNVs)AUROC (zero-shot; SpliceVarDB exonic SNVs)
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)0.733Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.904Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA1 coding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)Not reported0.571Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.823Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA1 intronic SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reported0.32Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.885Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA1 noncoding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reported0.87Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.959Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA1 splice region SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reported0.897Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.942Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.57Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.835Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA2 coding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.306Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.727Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot BRCA2 noncoding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.714Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.874Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.993Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.968Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.977Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.973Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.949Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.964Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding indels classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.956Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.906Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding microsatellite variants classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.824Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.831Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding non-SNVs, far from splice site classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.953Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.914Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding non-SNVs, highly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.981Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.829Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding non-SNVs, moderately conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.914Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.807Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding non-SNVs, not conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.825Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.771Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding non-SNVs, poorly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.859Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.789Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.883Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.83Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding SNVs, far from splice site classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.881Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.832Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding SNVs, highly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.911Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.756Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding SNVs, moderately conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.686Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.831Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding SNVs, near splice site classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.925Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.82Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding SNVs, not conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.546Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.877Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar coding SNVs, poorly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.612Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.863Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar low SpliceAI and Pangolin scores (both below 0.1) non-SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.248Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.783Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar low SpliceAI and Pangolin scores (both below 0.1) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.353Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.881Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding indels classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.849Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.932Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding microsatellite variants classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.417Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.989Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding non-SNVs, far from splice site classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.616Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.873Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding non-SNVs, highly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.957Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.914Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding non-SNVs, intergenic classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.775Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.625Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding non-SNVs, moderately conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.784Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.884Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding non-SNVs, near splice site classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.931Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.93Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding non-SNVs, not conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.189Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.674Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding non-SNVs, poorly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.259Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.888Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding SNVs, far from splice site classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.432Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.85Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding SNVs, highly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.993Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.949Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding SNVs, intergenic classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.674Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.744Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding SNVs, moderately conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.777Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.941Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding SNVs, near splice site classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.992Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.972Not reportedNot reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding SNVs, not conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.4Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.833Not reportedNot reportedNot reported
Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot ClinVar noncoding SNVs, poorly conserved classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.525Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.874Not reportedNot reported
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Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)EvaluationZero-shot SpliceVarDB exonic SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1), SpliceVarDB experimentally validated splice variants (Brixi et al. 2026)Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.534Not reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reportedNot reported0.681
All 90 result rows with coverage, uncertainty and sources
Filter evaluations

Applied filters: All linked evaluations

Exact evaluated configurations and original reported results
Tested configurationProtocol and datasetFindingEvidence and details
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0.733 AUPRC (zero-shot; BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs)
unitless · higher

Uncertainty: Not reported by the source

Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

Author-reported evaluation · Source checked
Methods, coverage and source

Evo 2 7B on BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs (Evo 2 paper)

gfm-guides-20261014-evo2-brixi2026-protocol-brca1-both-snv

Aggregation: Not reported

Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J620, row 620: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
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0.904 AUROC (zero-shot; BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs)
unitless · higher

Uncertainty: Not reported by the source

Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

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Methods, coverage and source

Evo 2 7B on BRCA1 'Both' (coding and noncoding) SNVs (Evo 2 paper)

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Aggregation: Not reported

Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I620, row 620: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
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0.571 AUPRC (zero-shot; BRCA1 coding SNVs)
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Uncertainty: Not reported by the source

Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

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Methods, coverage and source

Evo 2 7B on BRCA1 coding SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J621, row 621: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Coding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
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0.823 AUROC (zero-shot; BRCA1 coding SNVs)
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Uncertainty: Not reported by the source

Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

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Methods, coverage and source

Evo 2 7B on BRCA1 coding SNVs (Evo 2 paper)

gfm-guides-20261014-evo2-brixi2026-protocol-brca1-coding-snv

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I621, row 621: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Coding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
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Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

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Evo 2 7B on BRCA1 intronic SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J693, row 693: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Intronic', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
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Uncertainty: Not reported by the source

Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

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Evo 2 7B on BRCA1 intronic SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I693, row 693: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Intronic', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
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0.87 AUPRC (zero-shot; BRCA1 noncoding SNVs)
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Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

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Evo 2 7B on BRCA1 noncoding SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J622, row 622: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Noncoding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA1 noncoding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)
0.959 AUROC (zero-shot; BRCA1 noncoding SNVs)
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Uncertainty: Not reported by the source

Coverage: Not reported scored / Not reported eligible

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Methods, coverage and source

Evo 2 7B on BRCA1 noncoding SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I622, row 622: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Noncoding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA1 splice region SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)
0.897 AUPRC (zero-shot; BRCA1 splice region SNVs)
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Evo 2 7B on BRCA1 splice region SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J678, row 678: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Splice region', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA1 splice region SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA1 saturation genome editing SNVs, Findlay et al. 2018 classes (Brixi et al. 2026)
0.942 AUROC (zero-shot; BRCA1 splice region SNVs)
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Evo 2 7B on BRCA1 splice region SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I678, row 678: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA1', Genomic_Feature 'Splice region', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)
0.57 AUPRC (zero-shot; BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs)
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Evo 2 7B on BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J565, row 565: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA2', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)
0.835 AUROC (zero-shot; BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs)
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Evo 2 7B on BRCA2 'Both' (coding and noncoding) SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I565, row 565: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA2', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA2 coding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)
0.306 AUPRC (zero-shot; BRCA2 coding SNVs)
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Evo 2 7B on BRCA2 coding SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J539, row 539: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA2', Genomic_Feature 'Coding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA2 coding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)
0.727 AUROC (zero-shot; BRCA2 coding SNVs)
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Evo 2 7B on BRCA2 coding SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I539, row 539: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA2', Genomic_Feature 'Coding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA2 noncoding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)
0.714 AUPRC (zero-shot; BRCA2 noncoding SNVs)
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Evo 2 7B on BRCA2 noncoding SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J555, row 555: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA2', Genomic_Feature 'Noncoding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot BRCA2 noncoding SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: BRCA2 SNVs with functional classifications, Huang et al. 2025 (Brixi et al. 2026)
0.874 AUROC (zero-shot; BRCA2 noncoding SNVs)
unitless · higher

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Evo 2 7B on BRCA2 noncoding SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I555, row 555: Model 'Evo 2 7B', Data 'BRCA2', Genomic_Feature 'Noncoding', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.993 AUPRC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels)
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Evo 2 7B on ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J589, row 589: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'Indel', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.968 AUROC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels)
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Evo 2 7B on ClinVar 'Both' (coding and noncoding) indels (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I589, row 589: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'Indel', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.977 AUPRC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants)
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Evo 2 7B on ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J600, row 600: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'Microsatellite', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.973 AUROC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants)
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Evo 2 7B on ClinVar 'Both' (coding and noncoding) microsatellite variants (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I600, row 600: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'Microsatellite', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.949 AUPRC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs)
unitless · higher

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Evo 2 7B on ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J578, row 578: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.964 AUROC (zero-shot; ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs)
unitless · higher

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Evo 2 7B on ClinVar 'Both' (coding and noncoding) SNVs (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I578, row 578: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Both', Variant_Type 'SNV', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar coding indels classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.956 AUPRC (zero-shot; ClinVar coding indels)
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Evo 2 7B on ClinVar coding indels (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell J63, row 63: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Coding', Variant_Type 'Indel', Sub_category '', column 'AUPRC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar coding indels classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.906 AUROC (zero-shot; ClinVar coding indels)
unitless · higher

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Evo 2 7B on ClinVar coding indels (Evo 2 paper)

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Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Data 1, human variant effect prediction results (Nature 2026); Genome modelling and design across all domains of life with Evo 2: Supplementary Information (Nature 2026) · Supplementary Data 1 (sheet 'Sheet1') cell I63, row 63: Model 'Evo 2 7B', Data 'ClinVar', Genomic_Feature 'Coding', Variant_Type 'Indel', Sub_category '', column 'AUROC'
Configuration: Evo 2 7B (Evo 2 paper variant effect evaluations)Protocol: Zero-shot ClinVar coding microsatellite variants classification (Evo 2 paper, Supplementary Data 1)
Dataset: ClinVar October 2024 release, filtered (Brixi et al. 2026)
0.824 AUPRC (zero-shot; ClinVar coding microsatellite variants)
unitless · higher

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Evo 2 7B on ClinVar coding microsatellite variants (Evo 2 paper)

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contexts
research
method types
foundation_model
reported name
Evo 2 7B
foundation model eligible
true
parameters
7B parameters; context extended to 1,048,576 tokens (SI Supplementary Table 3)
source locator
Supplementary Data 1 column 'Model' ('Evo 2 7B'); SI A.1.4 and Supplementary Table 3 (page 3); Discussion
version
Evo 2 7B, 1M-token context after midtraining
access reuse
Released openly with training and inference code, data and parameters (Discussion)
missing metadata
checkpoint revision: reason: unreported
provenance note
Evo 2 7B as scored zero-shot by the Evo 2 authors on human variant effect benchmarks.
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